Ketika Alita terbangun tanpa ingatan tentang siapa dia di dunia masa depan yang tidak dia kenali, dia dibawa oleh Ido, seorang dokter penuh kasih yang menyadari bahwa di suatu tempat di dalam cangkang cyborg yang ditinggalkan ini terdapat hati dan jiwa seorang wanita muda dengan masa lalu yang luar biasa.
